2003年,雁山区实行机构改革,雁山区教育局与科技局合并,成立雁山区教育科技局同年,撤销乡镇教育管理委员会及其办公室(乡镇文教办),雁山区辖中小学校由雁山区教育行政部门直接管理,实施“以县(区)为主”的农村义务教育管理体制,雁山区始终把基础教育放在优先发展的地位,坚持“科教兴区”战略,积极谋划教育发展规划,巩固提高“两基”和“普实”成果,全面实施素质教育,努力提高办学水平。2005年,荣获“桂林市中小学实验教学先进单位”称号;2007年,顺利通过国家“两基”验收;2008年,荣获自治区“规范收费示范县(区)”称号;2009年,通过市级“两基”复查抽查验收;2010年,通过自治区“义务教育学校常规管理达标县(区)”评估验收,同年,被评为“广西农村中小学财务管理规范市级规范县(区)”;2012年,被列为桂林市义务教育均衡发展和学生营养改善计划试点;2014年,通过市级义务教育发展基本均衡县(区)评估复核;2015年,通过自治区级义务教育发展基本均衡县(区)评估复核。
站在历史的新起点,展望未来,雁山教育将继续坚持高举邓小平理论和“三个代表”重要思想伟大旗帜,全面贯彻落实科学发展观、“四个全面”战略布局和党的教育方针,抓住桂林国际旅游胜地和雁山“三区两带”建设发展机遇,创新工作思路,改善办学条件,提升教育内涵,优化学校布局,整合教育资源,提高教师队伍素质,不断满足全区人民群众对教育的需求,努力办好人民满意的教育,促进雁山教育全面、科学、持续发展。